В 1905 Людвик Петрович руководил подводными раскопками в районе Карантинной горки: под его началом водолазы извлекли со дна моря античные амфоры. Особенно ценны его труды по истории генуэзских колоний в Крыму, опубликованные в ИТУАК. В них автор предстает популяризатором, стремящимся пробудить интерес читателей к своей любимой теме, сделать более доступным относящийся к ней фактический материал.
Все вместе эти сочинения фактически составляют монографию, в которой публикуются и анализируются источники (большинство из них до сих пор не издано в русском переводе), выясняются подробности ситуации, сложившейся в генуэзских колониях накануне прихода турок, причины падения итальянских колоний. Колли продемонстрировал прекрасное знание истории Крымского ханства и его взаимоотношений с генуэзской Каффой. Особый интерес проявлял он к личностям, выяснению их роли в исторических событиях. Причем, это были не только персонажи из далекого прошлого, но и люди нового времени, в том числе современники Людвика Петровича, память о коих он хотел сохранить.
Его научная деятельность была известна не только в России, но и за границей. В 1906 он стал участником Международной выставки в Милане, послав на нее фотографии и рисунки древних феодосийских надписей, генуэзских укреплений, план Каффы. Он переписывался с известными итальянскими учеными, поддерживал связи с Лигурийским обществом истории, которое в 1914 избрало его своим почетным членом и наградило командорским крестом ордена Итальянской Короны.