Феодосийский музей древностей входит в число старейших музеев мира, является старейшим из ныне действующих музеев Украины. Он был открыт по инициативе феодосийского градоначальника С. М. Броневского 13 (25) мая 1811 года. Более века он назывался Феодосийским музеем древностей, некоторое время — археологическим. Статус краеведческого музей получил в середине 30-х годов 20-го века.
Открытие музея в Феодосии было обусловлено большим количеством исторических памятников в нашем городе и общим развитием краеведения исторической науки в Российской империи в начале 19-го века. Вслед за Феодосийским музеем Древностей открылись ставшие впоследствии знаменитыми музеи древностей в городе Одесса и в городе Керчь.
Первоначально Феодосийский музей древностей находился в помещении заброшенной мечети. В 1871 года его коллекции были перенесены в новое здание, специально для этой цели построенное И. К. Айвазовским на холме Митридат. В этом оригинальном помещении музей размещался почти полвека. В годы Великой Отечественной войны бывшее здание музея на Митридате было разрушено.
С 1925 года музей занимал часть дома И. К. Айвазовского. Во время ВОВ наиболее ценные экспонаты в 1941 году были эвакуированы, но основная коллекция осталась в Ф. В период оккупации часть экспонатов была вывезена в Германию. В 1945 году Феодосийский музей древностей возобновил прием посетителей в доме И. К. Айвазовского. С 1988 году экспозиции музея размещены в здании – памятнике архитектуры 19-го века.
В комплектовании фондов и библиотеки музея , в создании экспозиции принимали участие видные отечественные историки, археологи, краеведы, такие как Н. Н. Мурзакевич, А. А. Сибирский, Е. Ф. Д-Вильнев, С. И. Веребрюсов, О. Ф. Ретовский, Л. П. Колли, А. Л. Бертье–Делагард, А. И. Новицкий, И. Б. Зеест, А. И. Айбабин и другие. В разное время посетителями феодосийского музея Древностей были представители династии Романовых: российские императоры Николай I и Александр II, Великие Князья Константин Николаевич и Кирилл Владимирович. Великий Князь Николай Павлович – будущий император Николай I считался первым официальным дарителем Феодосийского музея.
Собрание музея комплектовалось и комплектуется за счет материалов разнообразных научных экспедиций, даров, случайных находок. В фондах музея древностей (краеведческого музея) хранится много уникальных памятников истории и культуры. Экспозиция музея отражает все этапы истории юго-восточного Крыма эпохи первобытно – общинного строя до событий Великой Отечественной войны, знакомит с прошлым одного из древнейших городов Европы, города 25 – веков, Феодосии. Отдельный зал посвящен неповторимой природе края. В лапидарном дворике музея экспонируются эпиграфические, лапидарные памятники, повествующие о многих народах, оставивших свой след в истории Крымского полуострова.