За столь короткий срок коллекция музея значительно увеличилась за счет покупок, подарков, но в первую очередь благодаря добытым Евгением Францовичем в ходе раскопок памятникам древности (за предшествующие полсотни лет существования музея не было собрано столько вещей, сколько за годы заведования им Вильнёвым). Составленные им музейные описи отличались полнотой, скрупулезностью и легли в основу будущих печатных «Указателей Феодосийского музея древностей».
Труды: Письмо из Феодосии // ОВ. 1850. 8 марта; Наблюдение в Феодосии // ОВ. 1851. 11 авг., 1853; «Album historique et pitto-risque de la Tauride», Париж, 1853.
Архивные материалы: ГААРК: Ф. 26. Он. 1. Д. 17513. О поручении члену Карантина г. Вильнёву заведование музеумом. 1849. 3 л.; Д. 20878. Об исходатайство-вании денежной награды члену Феодосийского карантина де-Вильнёву. 1855-1858. 23 л.; Ф. 195. Оп. 1. Д. 1535. По предписанию таврического губернатора о сдаче Феодосийского музеума, находившегося временно в заведовании непременного члена правления Казанли, члену Вильнёву. 1849. 2 л. ГАОО: Ф. 93. Оп. 1. Д. 2. Журнал заседаний ООИД. Ч. 2. 1845-1849. Л. 89 об., 105 об., 111 об.; Ф. 93. Оп. 1. Д. 3. Протоколы заседаний ООИД от 68 до 107. Ч. 3.1850-1859. Л. 1 об., 5-6,14 об.-15,19-19 об., 20 об., 30 об., 45 об.-47,62 об.-63,67,74,88 об., 93 об., 99 об., 128,139 об., 143; Ф. 93. Оп. 1. Д. 4. Протоколы заседаний ООИД. Ч. 4. 1860-1870. Л. 3-4, 68;